为了阻止地球人探索太空,宇宙怪人纳佐计划用伊卡洛斯惑星撞击地球。联合国秘密机关-珍珠研究所的成员观测到伊卡洛斯惑星的轨道异常,于是便制造超破坏光线炮以摧毁伊卡洛斯惑星。就在超破坏光线炮即将完成的时候,负责寻找用来制造光线炮特殊镜片的原石的小队发出了求救信号。
研究所成员按照信号指示来到了探索小队出意外的地方,而那里竟然是再次浮出海面的亚特兰蒂斯大陆。在那里,研究所成员发现探索小队人员已全部遇害,接着他们受到从海底出现的纳佐之塔的攻击,于是一行人逃进一座神殿内。
在神殿寻找出路的时候,研究所成员挖出了一副棺材。按照棺上文字所说,棺内的人名叫黄金蝙蝠,他预知一万年后地球将有危机,如果用水将他唤醒的话他就会再次为正义而战。这时,探测器显示棺材内有原石反应。当研究所成员把棺材打开的时候,他们发现躺在里面的竟然是一具金色的骷髅……
就在此时,神殿已经被纳佐的追...